來自中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院的消息顯示，該院生物技術(shù)研究所谷曉峰課題組和田健研究員合作建立了水稻表觀遺傳智能數(shù)據(jù)庫eRice，創(chuàng)新性展示了DNA新核酸甲基化圖譜和人工智能預(yù)測的修飾位點(diǎn)，同時(shí)也包括了其他類型的表觀修飾，可為水稻功能基因組研究和智能設(shè)計(jì)育種提供支撐。相關(guān)研究結(jié)果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)雜志（Plant Biotechnology Journal）》上。
表觀遺傳是指在不改變DNA、RNA或蛋白序列的情況下，發(fā)生可遺傳的基因表達(dá)變化，參與生長發(fā)育、基因表達(dá)調(diào)控、響應(yīng)環(huán)境信號(hào)等多個(gè)方面，是生物性狀多樣性的基礎(chǔ)。
據(jù)介紹，課題組建立的eRice數(shù)據(jù)庫整合了粳稻品種“日本晴”和秈稻品種“93-11”的DNA腺嘌呤甲基化和胞嘧啶甲基化全基因組圖譜、腺嘌呤甲基化的人工智能預(yù)測數(shù)據(jù)、組蛋白修飾組學(xué)數(shù)據(jù)，以及提升的基因組信息。表觀組和基因組數(shù)據(jù)的整合提升了數(shù)據(jù)利用和深度挖掘能力，實(shí)現(xiàn)了基因序列和注釋信息、DNA甲基化、組蛋白修飾及DNA甲基化智能預(yù)測數(shù)據(jù)的系統(tǒng)查詢和一體化展示。數(shù)據(jù)庫將持續(xù)更新表觀組學(xué)數(shù)據(jù)，為水稻重要農(nóng)藝性狀的智能設(shè)計(jì)改良提供信息平臺(tái)和數(shù)據(jù)支撐。
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